Puede conectarse a una base de datos externa desde su instancia de joomla sin usar el recurso actual de su base de datos de joomla. Intente esto:
<?php
$option = array(); //prevent problems
$option['driver'] = 'mysql';
$option['host'] = 'dbase.host.com';
$option['user'] = 'login';
$option['password'] = 'pwd';
$option['database'] = 'anotherdb';
$db = & JDatabase::getInstance( $option );
?>
Para obtener más información sobre esto, consulte Joomla! Documentación
