Compruébelo usted mismo, ya sabe lo que está buscando en su aplicación SIG:http://www.bostongis.com/PrinterFriendly.aspx?content_name=sqlserver2008_postgis_mysql_compare
En general, PostGIS es mucho más maduro y es muy flexible. Puede crear cualquier función, operador, tipo de índice o lo que sea. No tiene (casi) límites.