Recientemente encontré un problema similar con MySQL en uno de mis sistemas de producción.
Como señaló un comentarista anteriormente, el problema es la búsqueda con comodines en el campo de texto y, en particular, el % inicial en la búsqueda.
Redujimos el % líder y redujimos el tiempo necesario para realizar una consulta de búsqueda en varios órdenes de magnitud (desde un servidor que dura más de 60 segundos a "nada de tiempo").
Las alternativas serían usar un índice de texto completo o un sistema como Lucene para buscar.
