Por favor, intente esta consulta Mysql. Esto resolverá su problema. No requerimos que se una a la tabla de empleados. Si no está tomando ningún dato de la tabla de empleados, no agregue la tabla de empleados en la combinación.
SELECT
p.name AS ProjectName,
Count( t.employeeID ) AS NumMembers
FROM
Project p
LEFT JOIN ProjectAssignment t ON p.id = t.projectID
GROUP BY
p.name
Salida:
Project name NumMembers
Alpha 3
Bravo 2
Charlie 2
Delta 0