Segundos últimos registros

Aquí hay una opción usando user-defined variables para establecer un número de fila por grupo de comercios y luego filtrar el 2º en cada grupo ordenado por contratos:

select * 
from (
  select *, 
      @rn:=if(@prevMerchantId=merchantid,
              @rn+1,
              if(@prevMerchantId:=merchantid, 1, 1)
              ) as rn
  from yourtable cross join (select @rn:=0, @prevMerchantId:=null) t
  order by merchantId, contractid desc
  ) t
where rn = 2

• Demostración de SQL Fiddle