Puedo darte la idea básica de cómo puedes hacer esto. Simplemente cree un enlace para cada fila que redirigirá el control a delete.php (el archivo que realizará la eliminación). El control solo se redirigirá en caso de que su usuario confirme la operación de eliminación. El enlace puede ser así.
<a class="button" href="<?php echo base_url();?>delete.php/<?php echo $row->id;?>" onclick="javascript: return confirm('Are you SURE you wish to do this?');">Delete</a>
