MySQL une solo filas seleccionadas

Puedes hacer

SELECT SUM(netto)
FROM   invoices
       LEFT JOIN invoices_elements
         ON invoices_elements_code_invoices_id = invoices_id
            AND invoices_elements_enable = 1
WHERE  invoices_enable = 1
GROUP  BY invoices_elements_code_invoices_id  

Tenga en cuenta la restricción invoices_elements_enable = 1 está en ON cláusula para evitar convertir la consulta en una inner join .