Usa FIND_IN_SET()
para buscar un elemento de una lista separada por comas.
$lsc_adminid_query = xtDBquery("
SELECT lsc.option_id
FROM lsc_config lsc
WHERE FIND_IN_SET({$_SESSION['customer_id']}, lsc.option_value)");
Pero sería mejor normalizar su diseño para que no tenga listas separadas por comas en las columnas de la base de datos en primer lugar.