Esto probablemente sucede porque no reinstaló las herramientas de la línea de comandos después de la actualización.
Por lo general, XCode debe actualizarse a la última versión (4.4) (creo que cuando actualicé a 10.8 también actualicé muchas otras aplicaciones, incluido XCode). Después de la actualización, debe volver a instalar las herramientas de línea de comandos. Esto ahora se puede hacer a través de una configuración en XCode:
Vaya a "Preferencias -> Descargas" e instale "Herramientas de línea de comandos".
Ahora no debería tener más problemas al instalar paquetes que necesitan ser compilados.
