Me enfrenté al mismo problema. Seguí estos pasos y funciona bien,
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Vaya a su espacio de trabajo, p. C:\Espacio de trabajo
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Luego abra la carpeta .metadata.plugins desde su espacio de trabajo.
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Eliminar debajo de 2 carpetas,
- org.eclipse.e4.workbench
- org.eclipse.equinox.p2.ui.sdk
Eclipse debería comenzar después de esto.