Si ya instaló MySQL y no realizó un apagado lento usando el
innodb_fast_shutdown
Flag, simplemente vaya a su directorio MySQL
/var/lib/mysql/
Y elimina los archivos de registro (No hagas esto si necesita los datos de la tabla en su base de datos hasta ha hecho una copia de seguridad de su base de datos):
ib_logfile0
ib_logfile1
Haz una copia de seguridad antes si los necesita de nuevo.