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Parece ser un error en phpmyadmin
Actualicé a la versión 3.4.0 y el mensaje desapareció.
phpmyadmin error #1062 - Entrada duplicada '1' para la clave 1
Cómo crear un diagrama ER en DBeaver
Editor de datos:una breve descripción
¿Cómo veo mis procedimientos almacenados en phpMyAdmin?