Finalmente lo encontré.
Aparentemente, hubo algunos problemas de incompatibilidad después de actualizar a MySQL 5.6.
Para verificar dichos problemas y solucionarlos, deberá realizar una actualización de MySQL.
Simplemente ejecute lo siguiente en una terminal:
mysql_upgrade -u root -p
Ingrese su contraseña y espere hasta que finalice la actualización.
Esto me solucionó el problema.
