Tengo la solución.
Estaba importando/exportando usando phpmyadmin. Así que nos enfrentamos a estos problemas.
Ahora probamos con la línea de comandos y todo funciona bien sin ningún problema.
Use esto para exportar:
mysqldump -u username -p databasename > filename.sql
Use esto para importar:
mysql -u username -p databasename < filename.sql
