Exportar el resultado del marco de agregación de mongodb a una nueva colección

A partir de Mongo 2.6.0 puede hacerlo de forma nativa sin ninguna manipulación adicional.

db.<collection>.aggregate( [
     { <operation> },
     { <operation> },
     ...,
     { $out : "<output-collection>" }
] )

Consulte el nuevo operador de agregación $out para ver un ejemplo más detallado.

PD de esta manera, no está limitado a un tamaño de 16 Mb.