Tuve un problema similar y tuve que resolverlo en dos pasos:
$ docker exec <id> bash -c "mkdir -p /extract; cp -f /path/to/fileset* /extract"
$ docker cp <id>:/extract/. .
Tuve un problema similar y tuve que resolverlo en dos pasos:
$ docker exec <id> bash -c "mkdir -p /extract; cp -f /path/to/fileset* /extract"
$ docker cp <id>:/extract/. .