¿Cómo almacenar el resultado de la consulta (un solo documento) en una variable?

Necesitas usar var así:

> var a = db.col.find().limit(1)
{ "_id" : ObjectId("52dfccba5fd17fe6a4d0051a"), "a" : 16807, "b" : 475249 }
> a
{ "_id" : ObjectId("52dfccba5fd17fe6a4d0051a"), "a" : 16807, "b" : 475249 }

Al hacer algunas pruebas, noté que find() El método parece estar configurando la variable en un cursor. En estos casos, pierde la variable después de la siguiente instrucción.

> var a = db.col.find().limit(1)
{ "_id" : ObjectId("52dfccba5fd17fe6a4d0051a"), "a" : 16807, "b" : 475249 }
> var b = 'test'
> a
>

Si necesita mantener la variable por más tiempo, intente iterar explícitamente la variable antes de configurarla usando toArray() .

> var a = db.col.find().limit(1).toArray()
{ "_id" : ObjectId("52dfccba5fd17fe6a4d0051a"), "a" : 16807, "b" : 475249 }
> var b = 'test'
> a
[
  {
    "_id" : ObjectId("52dfccba5fd17fe6a4d0051a"),
    "a" : 16807,
    "b" : 475249
  }
]