Está mapeando el campo de identificación incorrectamente en la etapa de proyecto y de grupo.
Debería ser _id no identificación También cambie el tipo de correo electrónico a Cadena. Funciona para mí.
GroupOperation groupOp = Aggregation
.group("firstName", "lastName", "email", "status", "_id")
.addToSet("department").as("department").addToSet("address").as("address");
ProjectionOperation projectStage = Aggregation.project("firstName", "lastName", "email", "status", "department", "address", "_id");
...
AggregationResults<EmployeeOutFacet> EmployeeOutList = mongoTemplate.aggregate(aggregation, mongoTemplate.getCollectionName(Employee.class), EmployeeOutFacet.class);