Usando el controlador nativo, puedo ejecutar un comando fuera del objeto db de la siguiente manera:
var MongoClient = require("mongodb").MongoClient;
MongoClient.connect(database, function (err, db) {
if (!err) {
db.command({ distinct: "Messages", key: "session" }, function (err, result) {
//more code here
});
}
});
Me di cuenta de que está ejecutando el comando fuera del objeto de colección, ese podría ser el problema.