No es posible hacerlo de esta manera. distinto
es un comando de base de datos, y --query La opción permite usar solo una consulta
para filtrar documentos.
Si usa mongodb v3.4 o posterior, puede usar vistas para agregar su colección y exportarla desde la vista.
Primero crea la vista en mongo shell:
db.createView("distinctCollectionUid", "collection", [{ $group: { _id: "$uid"}}]);
Luego expórtalo:
mongoexport -d db -c distinctCollectionUid --type=csv -f "_id" -o distinctUid.csv
