Primero, ese no es el frasco correcto. El jar al que hace referencia arriba contiene los javadocs.
El contenedor del controlador es:mongo-java-driver-2.9.3.jar .
En segundo lugar, debe agregar el jar al classpath de su proyecto para poder usarlo. Estos no son jars ejecutables. Eche un vistazo a los documentos de introducción aquí:
No hay "instalación" del controlador. Simplemente lo agrega como una dependencia en su proyecto y lo usa en su código. Tienes que instalar la base de datos en sí. Los paquetes de instalación para la base de datos están disponibles aquí:http://www.mongodb.org/downloads
