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MongoDB:actualiza documentos en una matriz

Creo que aún necesitará hacer esto con dos consultas. Pero, usando una consulta $ para update , puede mantenerlo en una consulta en el caso de que el EID ya exista.

db.col.update({"events.eid": 2}}, {$set: {"events.$.title: "Event 4", "events.$.start": new Date(2013, 08, 02}})

Si el valor de retorno de eso indica que no se encontraron registros, puede insertarlo en su lugar.