Hay un error publicado para este problema:https://jira.mongodb.org/browse/ SERVIDOR-13735
Problema similar, se envía un GeoJSON válido para un índice de 2dsphere y está causando el mensaje "¿No se pueden extraer claves geográficas del objeto, geometría mal formada?" error.
Ha habido una serie de errores anteriores en los que GeoJSON válido estaba causando este mensaje de error. Los arreglaron en 2.6.x, pero parece que es nuevo. Me sumaría a JIRA, ya que ayudará a priorizarlo para solucionarlo.
