Utilice --eval y use secuencias de comandos de shell para modificar el comando pasado.
mongo --eval "print('apples');"
O haga variables globales (crédito a Tad Marshall):
$ cat addthem.js
printjson( param1 + param2 );
$ ./mongo --nodb --quiet --eval "var param1=7, param2=8" addthem.js
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