Puedes usar updateMany()
métodos de mongodb para actualizar múltiples documentos
La consulta simple es así
db.collection.updateMany(filter, update, options)
Para obtener más documentos de uppdateMany, lea aquí
Según su requisito el código de actualización será así:
User.updateMany({"created": false}, {"$set":{"created": true}});
aquí debe usar $set porque solo quieres cambiar creado de verdadero a falso. Para ref. Si desea cambiar todo el documento, no necesita usar $set