La versión que tiene Ubuntu en sus propios repositorios es bastante antigua. Puede agregar CRAN a su sources.list y obtenga la última versión a través de ese repositorio. Lea las instrucciones en esta página para obtener más información.
Con respecto a su pregunta real, parece que una llamada a socketConnection incluye un argumento de entrada que no admite. Compruebe qué versión del paquete está ejecutando, ¿es la misma que ejecuta en Windows 7? Además, actualice su versión de R a 2.15 usando el enlace de arriba.
