¿Podemos ejecutar el script SQL usando primero las migraciones de código?

Primero necesitas crear una migración.

Add-Migration RunSqlScript

Luego, en el archivo de migración generado, puede escribir su SQL.

// PLAIN SQL
Sql("UPDATE dbo.Table SET Created = GETDATE()");

// FROM FILE
var sqlFile = Path.Combine(AppDomain.CurrentDomain.BaseDirectory, @"Custom.sql"); 
Sql(File.ReadAllText(sqlFile));

Entonces corres

Update-Database