Tuve problemas con las tablas de proveedores de membresía de ASP.NET (índices no agrupados) y me faltaba el "WITH (NOLOCK)" declaración sobre el procedimiento almacenado aspnet_Membership_GetNumberOfUsersOnline etc.
La herramienta de migración que se encuentra aquí solucionó los problemas y exportó la base de datos a Azure.
https://sqlazuremw.codeplex.com/
Es un buen asistente que se conecta a su servidor SQL existente y migra la base de datos seleccionada a Azure.