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Clasificación natural con SQL Server

No es lo más rápido del mundo, pero debería hacer el trabajo:

ORDER BY CASE WHEN PTNT_VST_CSNO LIKE 'vmi%' THEN 0 ELSE 1 END
        ,CAST(replace(replace(PTNT_VST_CSNO, 'vmip', ''), 'vmop', '') as int)