Utilice SQL Server Asistente de Migración (SSMA)
Además de MySQL, es compatible con Oracle, Sybase y MS Access.
Parece ser bastante inteligente y capaz de manejar incluso transferencias no triviales. También obtuvo una interfaz de línea de comandos (además de la GUI), por lo que, en teoría, se puede integrar en algún proceso de carga por lotes.
Este es el enlace de descarga actual para la versión de MySQL https://www. .microsoft.com/en-us/download/detalles.aspx?id=54257
La versión estable actual (junio de 2016) 6.0.1 falla con el controlador ODBC de MySQL actual (5.3.6) durante la transferencia de datos. Todo de 64 bits. La versión 5.3 con el controlador ODBC 5.1.13 funciona bien.