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No se puede hacer una conexión JDBC a MySQL (usando Java, IntelliJ y Linux)

Desde su cadena de conexión, esta base de datos debe estar en la máquina local. ¿Puede intentar ejecutar este comando para asegurarse de que el socket esté abierto para las conexiones?

telnet 127.0.0.1 3306

y asegurarse de que se conecta? Es posible que no haya configurado su instancia de mysql para escuchar conexiones desde esta máquina o en esta dirección de interfaz. Si la conexión falla, debe modificar su configuración de mysql, por ejemplo:

http:/ /www.cyberciti.biz/tips/how-do-i-enable-remote-access-to-mysql-database-server.html