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¿Importa el límite de tamaño de VARCHAR?

Sí, es importante cuando indexas varias columnas.

fuente:http://dev.mysql.com/doc /refman/5.0/es/column-indexes.html

En una intercalación latin1, solo puede especificar hasta 3 columnas de varchar(255) .
While puede especificar hasta 50 columnas para varchar(20)

Indirectamente, sin el índice adecuado, ralentizará velocidad de consulta

En términos de almacenamiento, no hay diferencia,
como varchar representan variable-length strings