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integración de spring 3, hibernate 3, maven y mysql

Tienes una situación infernal JAR.

Por alguna razón, esta dependencia

<dependency>
    <groupId>org.springframework</groupId>
    <artifactId>spring-hibernate3</artifactId>
    <version>2.0.8</version>
</dependency>

que tiene un org.springframework.orm.hibernate3.annotation.AnnotationSessionFactoryBean la clase oculta el org.springframework.orm.hibernate3.annotation.AnnotationSessionFactoryBean clase, es decir mismo nombre, en esta dependencia

<dependency>
    <groupId>org.springframework</groupId>
    <artifactId>spring-orm</artifactId>
    <version>3.2.4.RELEASE</version>
</dependency>

Y esa clase no tiene un setPackagesToScan método. Deshazte del spring-hibernate3 dependencia. spring-orm debería ser más que suficiente. Puede descargar la fuente aquí y compruébelo usted mismo.