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Elimine o detenga las consultas de MySQL después de salir del script PHP

Puede verificar si la conexión del navegador a su servidor aún está abierta, usando el Mecanismos de manejo de conexiones y reaccionar apropiadamente.

Sin embargo, tenga en cuenta que cualquier consulta SQL que haya comenzado hasta ahora se ejecutará hasta completarse; si son complejos, esto puede llevar un tiempo, y no hay una forma en banda de terminarlos:necesitaría ver qué subproceso ejecuta qué y recolectar los subprocesos abandonados periódicamente.