No creo que lo que quieras sea posible:nunca lo he visto hecho, ya que cada biblioteca (PDO, mysql y mysqli) usa su propia conexión con Dabatase, lo que significa, como notarás, que las conexiones establecidas usando uno de ellos no se comparte con los demás.
Supongo que tendrá que encontrar una manera de migrar todo su código de una sola vez, al menos, para las partes que deben funcionar en las mismas transacciones.
