asegúrese de que la dirección IP de su máquina local, desde la cual intenta acceder a mysql a través de VPN, tenga privilegios para acceder a la base de datos.
mysql> select host,user,password from mysql.user;
+------+------+-------------------------------------------+
| host | user | password |
+------+------+-------------------------------------------+
| % | abcd | *9B3E7610FB431631340BD618E58D49DF1928A251 |
| % | sync | *1747319F3F87039C382597515F8742920D9B75D1 |
| % | root | *FAAFFE644E901CFAFAEC7562415E5FAEC243B8B2 |
+------+------+-------------------------------------------+
Asegúrese de que haya una entrada para la dirección IP de la máquina local para el usuario a través del cual está iniciando sesión. También puede usar % en el campo de host. % indica todos los usuarios.
Puede agregar privilegios a través del siguiente comando
mysql> grant all on *.* to 'root'@'%' identified by <password>.
mysql> flush privileges