Listas clasificables conectadas de jQuery, Guardar orden en MySQL

yo lo que haria es dividirlos

   data    :
    {
      sort1:$('#sortable1').sortable('serialize'),
      sort2:$('#sortable2').sortable('serialize')
    }

luego, cuando publique, puede obtener la solicitud y configurarla según sea necesario, espero que tenga sentido

entonces lo que hago es esto

parse_str($_REQUEST['sort1'],$sort1); 

foreach($sort1 as $key=>$value){
    //do sutff;
}