Gran diferencia de rendimiento de Postgresql cuando se usa IN vs NOT IN

Esto es de esperar. Puede obtener un mejor rendimiento usando WHERE NOT EXISTS en cambio:

SELECT k999a
FROM transaksi
WHERE NOT EXISTS (
    SELECT 1 FROM buku WHERE buku.k999a = transaksi.k999a LIMIT 1
);

Aquí hay una buena explicación de por qué para cada uno de los métodos:https://explainextended.com/2009/09/16/not-in-vs-not-exists-vs-left-join-is-null-postgresql/