mangosta validación personalizada usando 2 campos

Puedes hacerlo usando Mongoose 'validate' middleware para que tenga acceso a todos los campos:

ASchema.pre('validate', function(next) {
    if (this.startDate > this.endDate) {
        next(new Error('End Date must be greater than Start Date'));
    } else {
        next();
    }
});

Tenga en cuenta que debe envolver su mensaje de error de validación en un Error de JavaScript objeto al llamar a next para informar de un error de validación.