mongoose.Types.ObjectId es el ObjectId función de constructor, lo que desea usar en las definiciones de esquema es mongoose.Schema.Types.ObjectId (o mongoose.Schema.ObjectId ).
Entonces deviceSchema debería verse así:
var deviceSchema = schema({
name : String,
type : String,
room: {type: mongoose.Schema.Types.ObjectId, ref: 'Room'},
users: [{type:mongoose.Schema.Types.ObjectId, ref: 'User'}]
});