No estoy seguro de que sea una forma adecuada de hacerlo, enviar una eliminación probablemente podría causar daños a su servidor mongo, y deberá reparar su base de datos después en caso de falla.
Tal vez ya resolviste esta pregunta, pero esto es lo que hago:
mongo admin --eval "db.shutdownServer()"
Me conecto automáticamente a la colección del administrador y, a continuación, solo tengo que ejecutar la extinción.
Aquí está el enlace oficial sobre cómo detener Mongodb correctamente:http://api.mongodb.org/wiki/current/Starting%20and%20Stopping%20Mongo.html
Mejor
