¿Actualizar un documento de MongoEngine usando un dictado de python?

Bastante tarde para el juego aquí, pero FWIW, MongoEngine tiene una solución integrada para esto.

Independientemente de si desea create o update puedes hacer lo siguiente:

class Pets(EmbeddedDocument):
    name = StringField()

class Person(Document):
    name = StringField()
    address = StringField()
    pets = ListField(EmbeddedDocumentField(Pets))

p = Person(**{
    "name": "Hank",
    "address": "Far away",
    "pets": [{"name": "Scooter"}]
})
p.save()

Solo diferencia para update es necesario pegar en un id . De esa manera mongoengine no duplicará un documento con un id existente y actualícelo en su lugar.