Insertar campo con tamaño de matriz en mongo

Puede usar el .aggregate() método para $project sus documentos y devolver el $size de la matriz de elementos. Después de eso, deberá recorrer el resultado de la agregación utilizando .forEach bucle y $set el campo itemTotal para su documento usando "Bulk" operación para una máxima eficiencia.

var bulkOp = db.myDocument.initializeUnorderedBulkOp(); 
var count = 0;

db.myDocument.aggregate([
    { "$match": { 
        "itemsTotal": { "$exists": false } ,
        "items": { "$exists": true }
    }}, 
    { "$project": { "itemsTotal": { "$size": "$items" } } }
]).forEach(function(doc) { 
        bulkOp.find({ "_id": doc._id }).updateOne({ 
            "$set": { "itemsTotal": doc.itemsTotal }
        });
        count++;
        if (count % 200 === 0) {
            // Execute per 200 operations and re-init
            bulkOp.execute();
            bulkOp = db.myDocument.initializeUnorderedBulkOp();
        }
})

// Clean up queues
if (count > 0) { 
    bulkOp.execute();
}