Finalmente, encontré la solución reemplazando 'mongo-java-driver-2.11.3.jar' con 'mongo-java-driver-2.13.2.jar' en mi directorio Apache-JMeter lib. Puede que tenga algunos problemas con la autenticación de Mongo 3.
También modifiqué el código para que funcionara:
import com.mongodb.*
import com.mongodb.BasicDBObject
MongoCredential coreCredential = MongoCredential.createCredential("${mongodb_user}", "${mongodb_database}", "${mongodb_password}".toCharArray());
MongoClient coreMongoClient = new MongoClient(new ServerAddress("${mongodb_server}", 27017), Arrays.asList(coreCredential));
DB coreDB = coreMongoClient.getDB("${mongodb_database}");
DBCollection coll = coreDB.getCollection("users");
...
ahora todo funciona bien.