Creo que el problema puede residir en el hecho de que le estás dando un objeto de Python a app.config.from_object cuando espera una cadena. De los documentos:
app = Flask(__name__)
app.config.from_object('yourapplication.default_settings')
app.config.from_envvar('YOURAPPLICATION_SETTINGS')
http://flask.pocoo.org/docs/0.10/ config/#configuración-desde-archivos
Entonces, en su caso, es posible que desee hacer algo como:
app.config.from_object('your_app.config.{}'.format(config_name))
donde config_name coincide con el objeto en su config.py.
