Para cualquiera que haya enfrentado este error en 2020, con la versión 4.4.1 de mongo, y la respuesta aceptada no resolvió el problema, esto es lo que hice:
- Eliminar todos los servicios mongo de la PC (agregar/eliminar programas).
- Vaya a los archivos de programa y haga una copia de seguridad de la carpeta MongoDB.
- Elimine la carpeta MongoDB.
- Vuelva a instalar mongo db.
Y debería funcionar.
ACTUALIZAR para enero de 2021, lo siguiente me salvó sin reinstalar MongoDB y perder todos mis datos:
C:\Program Files\MongoDB\Server\4.4\bin>mongod --dbpath "C:\Program Files\MongoDB\Server\4.4\data" --repair
