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Uso del operador posicional con jerarquías de dos niveles en Mongo

No puede hacerlo ahora (existe tal error en jira). Pero supongo que puedes actualizar usando javascript del lado del servidor. Consulta este artículo para más detalles.

Otra forma de rediseñar su esquema de base de datos a un nivel de profundidad, por ejemplo, en el caso de publicaciones-> comentarios-> votos, mover comentarios (o incluso votos) en una colección separada.