Si está utilizando la última versión de mongo, puede usar $replaceRoot y $mergeObjects (referencia de respuesta de desbordamiento de pila )
let pipeline = [
{
"$replaceRoot":{
"newRoot":{
"$mergeObjects":[
{
"id":"$id"
},
"$properties"
]
}
}
}
]
db.collection.aggregate(pipeline)