Error findAndModify en mongodb - nodejs - código de error 17287

Parece que te falta el argumento "ordenar" en tu consulta.

Prueba algo como:

db.collection('counters').findAndModify(
    {_id:'productId'},
    {_id:'descending'},
    {$inc: {sequence_value:1}},

    function(err,data){
        if(!err)
            callback(data);
        else
            callback(err);
});

Vea más aquí:http://docs.mongodb.org/ manual/referencia/método/db.collection.findAndModify/