Uno de los desarrolladores del controlador me habló de un constructor muy interesante. Espero que esto sea útil para alguien en el futuro:
// Get all documents created today.
var query = Query.And(
Query.GTE("_id", new ObjectId (DateTime.UtcNow.Date,0,0,0)),
Query.LT ("_id", new ObjectId (DateTime.UtcNow.Date.AddDays(1),0,0,0)));